Jeśli instalator programu na Windows Mobile jest plikiem .exe, to podpinasz telefon do komputera w trybie Active Sync i kiedy telefon z komputerem się wykryją możesz to normalnie zainstalować (po prostu odpalasz .exe).

Jeśli jednak pytasz o instalację aplikacji pisanych na "prawdziwego" Windowsa - tutaj niestety, nie ma takiej opcji.